吉尔吉斯只有一座国际机场，即位于首都比什凯克的“玛纳斯”国际机场。该机场每周有定期航班飞往新德里、卡拉奇、伦敦、伊斯坦布尔、乌鲁木齐、法兰克福、沙迦等外国空港，以及莫斯科、明斯克、塔什干等独联体国家。比什凯克与吉国内的奥什、贾拉拉巴德、巴特肯等重要城市之间也有定期航班往来。

    “玛纳斯”机场是前苏联时期的建筑，设施陈旧落后。1999年，吉依靠日本贷款（55亿日元）开始对“玛纳斯”机场进行改造。改造项目包括：跑道、停机坪、侯机厅等。目前，“玛纳斯”机场第一期工程已经完工并交付使用，现已开始进行二期工程建设。